In my computer 是指在我电脑（实体）里面,比如说, I have a cd-rom in my computer.我的电脑里面有一个光驱。On my computer 是指在我电脑（系统/软体）上面，比如说，I have installed QQ on my computer. 我的电脑上装了QQ程序。
on the computer表示在电脑上做事情，如：
I do my homework on the computer.
我在电脑上做作业。
I work on the computer.
我在电脑上工作。
I make programs on the computer.
我在电脑上编程序。
in the computer表示电脑里的各种部件。如：
In the computer are two memories, a mainboard and a CPU.
在电脑里有两条内存，一块主板和一个中央处理器。