笼统的说就是基因工程或遗传工程。首先需要将Bt的杀虫基因修饰为棉花中能表达的，然后再将其通过花粉管通道转化技术或农杆菌介导的结合转移技术转入棉花细胞中，使其随机或特异整合到棉花染色体上，通过抗性选择、培养、再生成棉花植株。
基因同一性原理（DNA序列不同但编码同一蛋白质的基因，其功能是相同的。）、基因重组原理、遗传转化原理、植物细胞全能性原理等。
基因人工合成：通过人工合成技术，将细菌Bt的基因序列改造为棉花偏好“棉花基因”序列。
DNA重组原理：通过基因重组将上述修饰的Bt基因和棉花中表达所需的启动子、终止子等拼接为能在棉花中高效表达的完整“棉花基因”。同时加上便于将来筛选的遗传标记基因，如抗除草剂基因等。
遗传转化：通过花粉管通道或基因枪或农杆菌介导的结合转移将上述基因转入棉花细胞，通过遗传重组插入到棉花染色体上。
组织培养：利用植物细胞全能性原理，通过组织培养和筛选将上述转化的细胞培养成转基因植物。
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