先看《死亡与新生》（TV版的剪辑）然后是《Air/真心为你》
以下是<AIR.真心为你>的简要剧情 ：
三月上旬,某日上午5时59分,美理终于知道第2次冲击的秘密.
律子对MAGI加上666号防壁,SEELE下令直接强行占据NERV本部设施.上午6时正,5国支部MAGI同时入侵NERV本部,目标在夺取MAGI主系统.
同日,SEELE颁报A-801训令,取消NERV本部所有特权. 战自大队入侵,源渡宣报全员进入第一战斗态势. 第三新东京市遭到N^2爆雷疯狂轰炸,连同天井都市消失. 7时23分23秒,于46通道发现真嗣.美理出发救援. 明日香被运往贰号机,发射上70米深的湖底. 成功救回真嗣,并带真嗣往初号机而去.
明日香觉醒,向战自大队反击. 美理在第6紧急电梯入口被枪击受伤. 美理对真治献出最后一吻,后美理被炸死亡,享年29岁,之后真治乘电梯到第7收容处. 约2分钟后,律子意图执行自爆系统,但失败. 2分钟后,贰号机大战EVA量产机. 律子被源渡枪杀身亡,享年31岁. 源渡意图令ADAM与LILITH融合.
贰号机击败EVA量产机,电源用尽,但被无故飞来的复制朗基奴斯之枪插中头部,明日香惨叫. 贰号机暴走,但再被9枝复制朗基奴斯之枪射中. EVA量产机再起动,并将贰号机肢解.
初号机自行启动,欲真嗣乘坐其中.朗基奴斯之枪从大气层飞回初号机前.SEELE所谓的"仪式"开始进行. EVA量产机在初号机身上刻上圣痕. EVA量产机与初号机形成了Tree of Sephirot. S^2机关解放,释放高能量爆炸,战自大队全灭.
地下都市回归真实面貌,LILITH之卵,黑之月.
18使徒出现. 零背叛源渡,自行和LILITH融合,源渡失去右手.
EVA量产机与零同化.真嗣心理图混乱.初号机与朗基奴斯之枪同化,形成生命之树.反AT力场增大,生物已无法保持形态.
补完计划最后阶段. 灵魂之屋开启,全人类形体化成LCL. 真嗣放弃补完计划,走出第十八使徒.最后,地球出现生命之海.只剩下真嗣和明日香存活