怎么从全基因组上找到某一个特定基因

我从ncbi上找到了这个菌的全基因组,想从上面找到 tbp gcn4 gal4 mbcf adr1这四个的基因 回答得好我会加分的

    如果知道要找的基因的名字是可以很快的找到要找的序列,在基因名称检索界面输入就好。

    因为提交NCBI上的基因组都有预测CDS的,上面都标出每个CDS的可能功能及相应蛋白或酶的名字

    如果不知道基因名字,可以通过做比对来判断,可以尝试一下用BIOEDIT对比。

     

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第1个回答  推荐于2017-09-12
一般提交NCBI上的基因组都有预测CDS的,所以上面都有标出每个CDS的可能功能及相应蛋白或酶的名字,如果你知道你要找的基因的名字应该是可以很快的找到你要的序列。如果没有,那你只能通过做比对来判断了。可以用BIOEDIT比对试试。追问

我现在有我那个菌的全基因序列 也知道要找的蛋白的名字 就是想再已知全基因序列的这个菌里找到相应蛋白的基因序列

追答

你给我吧。我帮你弄。qq:36189787

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第2个回答  2015-08-15
一般提交NCBI上的基因组都有预测CDS的,所以上面都有标出每个CDS的可能功能及相应蛋白或酶的名字,如果你知道你要找的基因的名字应该是可以很快的找到你要的序列。如果没有,那你只能通过做比对来判断了。可以用BIOEDIT比对试试。
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