抗生素是兽医临床上应用最广、效果较好的一类药物，但若乱用、滥用，对生物安全、生态环境和人类健康都会带来严重的危害。因此，在生产中必须合理地使用抗生素，才有可能获得安全、最佳的效果。
（1）选择最敏感药物
应根据分离菌的药敏试验结果，选择最敏感药物用于实际防治，其效果最为理想。如无条件，则应选用作用强、广谱的、毒性低的抗生素进行预防和治疗。
（2）应注意抗生素的联合使用与交替使用
总的讲，联合用药一般可提高疗效、减少毒性作用和延缓细菌产生耐药性。联合用药一般适用于：①病原未明确的严重感染或败血症；②一种药物不能控制的混合感染；③容易出现耐药性细菌的感染。联合用药还应注意杀菌药物（青霉素类、先锋霉素类、氨基苷类等）或抑菌药物（四环素类、磺胺类等）间的联合，以达到协同或相加的作用，例如青霉素与链霉素、红霉素与氯霉素、磺胺药与三甲氧苄氨嘧啶等联合使用。
（3）应重视肝脏、肾脏功能与抗生素的关系
如当肝功能不良时，不应用经肝脏代谢、灭活的四环素、先锋霉素Ⅰ和氯霉素等药物；当肾功能不良时，使用经肾脏排泄的药物用量要适当减量或延长给药时间，以防止因排泄障碍而引发蓄积性中毒。
（4）及时分析抗生素治疗失败的原因
常见的失败原因大致有：①初步印象诊断与细菌学检查错误；②使用的抗生素选择不当；③使用的药物失效或药量不足、疗程太短或给药方法不当；④药物达不到损害器官组织或者说病害部位；⑤细菌产生耐药性；⑥鸽自身免疫机能低下。