法律分析：宅基地被他人恶意侵占，权利人可以通过以下方式维权：1、与直接侵权人协商处理，要求停止侵权行为。2、找当地村委会，派出所进行调解处理。3、收集侵权的证据，然后去法院起诉，要求停止侵权，排除妨碍。
法律依据：《中华人民共和国土地管理法》 第十六条 下级土地利用总体规划应当依据上一级土地利用总体规划编制。地方各级人民政府编制的土地利用总体规划中的建设用地总量不得超过上一级土地利用总体规划确定的控制指标，耕地保有量不得低于上一级土地利用总体规划确定的控制指标。省、自治区、直辖市人民政府编制的土地利用总体规划，应当确保本行政区域内耕地总量不减少。