新疆玉石的品种较多，包括和田玉、芙蓉石、水晶石、绿松石、黑菊花石等，比较常见的种类为：和田玉，产自昆仑山，又分为白玉、青玉、黄玉、墨玉等;金丝玉，产自新疆戈壁地区;玛瑙石，分布在新疆天山与东准噶尔。
1、和田玉
和田玉主要产自昆仑山北麓，东至若羌县，西起喀什，根据来源可分为山料和籽料，简单来说，矿采的叫山料，主要产于昆仑山，河里捞的则称为籽玉，主要产在玉龙喀什河和喀拉喀什河。根据颜色不同，和田玉也分为白玉，青白玉，青玉，黄玉，糖玉，墨玉等。
2、金丝玉
金丝玉也被称为“戈壁玉”，因为主要产自新疆的戈壁地区，又因其色彩艳丽，金丝玉也有“新疆彩玉”、“新疆雅丹彩玉”之称，其颜色多样，以红色、金黄质优稀有。
3、玛瑙石
玛瑙是火山喷发并迅速冷却的产物，经历了风沙、雨雪、酷暑、严寒磨炼所形成，新疆玛瑙主要分布在天山和东准噶尔，外形多变绮丽，色彩丰富，硬度达到7.8以上，堪称为大地之“舍利”。
4、丁香紫玉
丁香紫玉也叫丁香紫，属于新疆玉石的常见品种，主要因颜色类似于丁香花而得名，也是中档玉石的种类之一，一般是以玻璃光泽为主，从矿物学的角度来说，它属于单晶体矿物。
5、东陵玉
东陵玉主要盛产于新疆地区，内部中常有一些微小的晶粒、黄铁矿等，主要分为绿色和红色两种，大多是以不透明的状态为主，少数是半透明，绿色的东陵玉被人们称为印度翡翠。
新疆的玉石品种丰富，除以上外还有芙蓉石、水晶石、绿松石、黑菊花石、梅花石、钟乳石、阿克苏河石、乌尔禾卵石、于阗石、和田石、塔格石、戈壁彩石、戈壁泥石、玛河石、额河石、新疆碧玉、玛瑙石、硅化木、大漠石等。