法律分析：残疾人工资加计扣除按照支付给残疾职工工资的100%加计扣除。企业安置残疾人员的，在按照支付给残疾职工工资据实扣除的基础上，可以在计算应纳税所得额时按照支付给残疾职工工资的100%加计扣除。企业就支付给残疾职工的工资，在进行企业所得税预缴申报时，允许据实计算扣除;在年度终了进行企业所得税年度申报和汇算清缴时，再依照本条第一款的规定计算加计扣除。根据该规定，企业在进行所得税预缴申报时，还是按照实际发生数进行扣除，在年度申报和汇算清缴时可以按照实际发放的残疾员工的200%进行扣除。
法律依据：《中华人民共和国企业所得税法实施条例》 第九十六条 企业所得税法第三十条第（二）项所称企业安置残疾人员所支付的工资的加计扣除，是指企业安置残疾人员的，在按照支付给残疾职工工资据实扣除的基础上，按照支付给残疾职工工资的100%加计扣除。残疾人员的范围适用《中华人民共和国残疾人保障法》的有关规定。企业所得税法第三十条第（二）项所称企业安置国家鼓励安置的其他就业人员所支付的工资的加计扣除办法，由国务院另行规定。