法律分析：为方便企业填报,可根据实际情况采取下列方式填报:
(1)一般纳税人企业,在实际操作中也可以根据"增值税纳税申报表"计算该指标,计算公式为:应交增值税=销项税额-(进项税额-进项税额转出-免抵退货物应退税额).同时注意,计算该指标时应包括即征即退货物及劳务对应项目.
(2)执行简易征收办法的一般纳税人企业,可根据"增值税纳税申报表"中"简易征收办法计算的应纳税额"填报该指标.
(3)符合财税部门规定的对某些产品实行税额减征的一般纳税人企业,在根据"增值税纳税申报表"填报该指标时还应扣除"应纳税额减征额".
(4)小规模纳税人企业,可根据"增值税纳税申报表"中"本期实际应纳税额"填报.
根据《财政部、国家税务总局、中国人民银行关于进一步加强代扣代收代征税款手续费管理的通知》(财行[2005]365号)第六条第(六)款的规定,"三代"单位所取得的手续费收入应该单独核算,计入本单位收入,用于"三代"管理支出,也可以适当奖励相关工作人员.
因此,该手续费收入应当计入企业的收入.根据现行税收法规,代扣代缴个人所得税的手续费返还应按照"商务辅助服务--经纪代理服务"缴纳增值税.
对于企业取得的个税手续费返还收入,计入收入总额,计算缴纳企业所得税这是毫无疑问的,同时,对于用于该项代扣代缴工作的支出,也可以企业当年企业所得税汇算中扣除.
法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》 第八条 个人所得税,以所得人为纳税义务人,以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人".在企业履行代扣代缴义务后,税务机关会按年度支付企业手续费