拜占廷神学的主要来源是古典希腊哲学和犹太宗教的神秘思想，拜占廷帝国的主要疆域为希腊和希腊化地区，古代希腊哲学在这里产生了广泛而深刻的影响。
由于在基督教发展过程中形成了不同的教区，而这些教区有关神学的观点不尽相同，从而引发了他们争夺最高宗教地位的状况，由此形成大大小小、的宗派，使基督教教会长期陷于分裂。
现存佛罗伦萨图书馆的6世纪叙利亚古籍插图——基督受难和复活。9世纪以后，各教会之间的斗争更带有个人色彩。在斗争中，对立的各方大都利用神学教义问题为武器攻击对方，实质上并未提出任何新理论，几乎没有任何建树。他们共同的手段是无情打击异己分子，顺我者昌，逆我者亡，使东正教内部对立情绪极为严重。当某一宗派的首领去世后，东正教内部斗争就会暂时得到缓和或停止。但是，新的宗派和教派间的斗争随着新大教长的上任而又重新开始。
除了东正教内部争权夺利的教派之争外，教派斗争常常与世俗统治集团内部斗争相结合。如利奥六世皇帝统治时期，大教长尼古拉斯(901～907年，912～925年在任)为首的宗派则深深地卷入到“皇帝第四次婚姻”的是非争论中。
利奥六世(886～912年在位)的前三次婚姻都十分不幸，皇后塞奥发诺、邹伊和尤多酉亚先后早亡，所生一子三女中儿子也幼年夭折，王朝因此面临没有男性继承人的政治危机。
在婚姻问题上，拜占廷人几乎全盘继承了古罗马的婚姻法，但修改了罗马法关于夫权和离婚的规定：允许离婚和再婚。此后，由于教会影响的扩大，教会只承认第一次婚姻的神圣性，谴责第二次婚姻，至于第三次婚姻，教会法加以严格的限制，更别提是第四次婚姻。
利奥担心皇权旁落，因此与其情妇“黑眼圈”邹伊于公元905年生下一子，取名为君士坦丁。但是，当利奥打算明媒正娶邹伊为妻，进而使其子具有继承皇位的合法权力时却遭到教皇尼古拉斯的反对，他甚至禁止利奥进入教堂，因此被皇帝免职。在这一问题上，东正教教会内部再度陷入分裂，支持皇帝第四次婚姻的宗派在新任大教长尤塞米欧斯(907～912年在任)的领导下，积极参与利奥皇帝迫害反对派的行动，而尼古拉斯则支持大贵族杜卡家族对皇帝的斗争。两股势立形成对峙局面，相持不下。最后直到利奥死后，君士坦丁的合法地位经过多年的努力才得到认可。
“皇帝第四次婚姻”事件说明，东正教的分分合合往往与拜占廷世俗统治阶层的政治斗争密不可分，你中有我，我中有你。这种东正教教会参与皇室政治斗争的习俗一直持续到拜占廷末代王朝统治时期，如大教长阿森尼乌斯(1254～1265年在任)因参与拉斯卡利斯家族和帕列奥列格王朝之间的政治斗争而被罢免，其教会也难逃分裂的厄运。
现存佛罗伦萨图书馆的6世纪叙利亚古籍插图———基督受难和复活