自然界的次声波来源于多方面，如太阳磁暴、流星撞击、风暴、大海咆哮、火山喷发、雷鸣闪电等。各种人造机构也能成为次声源，如原子弹爆破、运载火箭的发射、鼓风机、真空泵、柴油机等。
在地球南北极附近，天空中时常会出现变幻莫测的极光，极光能产生可听到的声音，也可产生周期为几分之一秒至一分钟以内的次声。周期为几分钟、运动速度达到每秒500米的次声是极光弧产生的。周期为一分钟左右的极光次声是由电离层的整体运动产生的。
周期较短的次声是由极光中导电性的瞬时增加的局部极光电子喷射垂直穿过电离层引起的压力扰动而产生的。
地震前和地震时会发生奇怪的声音，有时像远处“隆隆”的火车声，有时像轰轰的飞机声，有时像雷鸣，有时像牛叫。这是人耳能听到的，还有人耳听不到的次声。
地震时，由于震中的激烈振动，产生纵波、横波和表面波，在地表面以不同的速度传播。这些复杂的振动会向空气辐射频率不同的声波。地面有山谷，也会衍射声波。所以地震产生的次声情况是复杂的。
火山喷发有不同形式，有的熔岩不断涌出，有的呈节奏性喷发，有的呈爆炸性喷发。不同喷发形式所产生的次声特性也不同。火山喷发时能量很大，1883年印度尼西亚的喀拉喀托火山爆发，把20多立方千米的岩石碎块抛向天空，据说几千千米之外还能听到“隆隆”的声音，产生的次声传播了10万多千米，绕地球转了好几圈。
龙卷风是激烈旋转的空气柱，从地面上接云端。龙卷风旋涡直径一般在几十米至几百米，风速可达每秒100米至每秒150米。观察到的与龙卷风相应的次声，其周期近一秒。
台风是一种反时针方向旋转的热带气旋。台风旋涡非常大，它的直径一般有几百千米，中间是台风眼，眼壁直径可达数十千米，台风眼中波浪互相叠加，形成驻波，高达10多米，发出的声波周期在4秒至8秒之间。雷暴、雹、风暴等恶劣天气都会发生次声，而且各有其特征。