一位亲历者刘人瑞记描述了他进入乾隆裕陵地宫时所见到的悲惨情形：持灯进入地宫，见有白骨数节浮于泥水之中。重敛者找到4具头颅，不能辨其是男是女，其情状比西太后陵凄惨百倍。
历史记载裕陵地宫葬有乾隆皇帝和两位皇后，还有三位皇妃。由于历时百年，又遭此浩劫，呈现在重敛者面前的仅剩零乱的骸骨。当人们清理遗骸时，最初只找到4具头颅。
专家介绍说，清室重敛时6个人只找到4个头骨，尸骸全碎，有一棺椁就压在石门下，从中找出一具头骨，骨骼较大而判断是乾隆颅骨。
找到乾隆颅骨后，还缺少一具头骨，棺椁里面找遍了也不见踪影，人们猜测可能被盗墓者带出了地宫。
就在人们快要放弃寻找时，令人吃惊的事情发生了，在地宫西北角的深水里浮现出一具完整的女尸，面目如生，令人惊异。根据推断，这具女尸应该是孝仪皇后。
令懿皇贵妃是嘉庆皇帝的生母，死后被追封为孝仪皇后。
这位孝仪皇后死于乾隆之前，同处一个地宫，为何唯独她的尸骨保持如此完好？遗臣们心中大惑不解。遗臣们心中的疑惑尚未解开，又一个问题让他们犯了难：如何区分那些散乱骨骸的身份呢？讨论了数日，最终决定合葬一棺，此举开创了有清以来帝后妃同葬一棺的惟一特例。
重新葬完慈禧、乾隆帝后妃遗骨后，人们盖上残缺的棺盖，掩闭石门，再将隧道完全填封。直到20世纪七八十年代，这两座地宫才再次被打开清理。
1984年，清东陵文物管理处对乾隆和慈禧两陵进行了整理。开棺结果验证了当年清遗族重殓时的记载。
2000年，清东陵被列入世界文化遗产保护名录。
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