普陀区初中排名前三的有进华中学、华东师大第四附属中学、梅陇中学。
1、进华中学。
进华中学，全称为上海华东师范大学附属进华中学，创建于1995年，位于上海市，是一所民办中学。截至2019年3月20日，学校占地面积2.3万平方米。党委书记是闫笑，校长是陈国强。校训为“求真、博学”。截至2021年11月9日，进华中学有27个班级。进华中学在2018年加入华东师范大学基础教育集团，并更名为上海华东师范大学附属进华中学。
学校为学生提供无人机课程、网球课程、编程课程、VR体验等系列课程。教学设施齐全、校园幽美、校舍俨然。学校现有28个教学班，1300余学生，教职工有130余人，其中高级教师占教师数70%左右。初三毕业生80%以上考入市重点中学，高三毕业生的重点大学入学率在60%以上。
2、华东师大第四附属中学。
为适应上海市城区重点建设项目普陀区长风生态商务区的建设和协调，充分突出教育优先发展的战略思想，普陀区人民政府和华东师范大学共同创办一所精品优质公办中学华东师范大学附属第四附属中学。2009年11月5日下午，华东师范大学第四附属中学在长风开发区建设指挥部会议室举行了揭牌仪式。新校区将于2014年9月1日正式启用。
华东师范大学第四附属中学是由原上海市晋元中学初中部转制成的民办新源中学和原云岭实验中学合并之后组建的华东师范大学附属长风中学易名而来。学校占地面积34400平米，建筑面积31663平米，绿化面积占35.09%。新校设250米跑道运动场一个、拥有图书馆、皮艇体训室、书法、篆刻、影画创客中心、安全教育体验室等个性化特色专用教室40余间。
3、梅陇中学。
梅陇中学即上海市梅陇中学，一所转制高级中学。上海市梅陇中学转制十年来，教育教学和其他各项工作均取得较为显著的成绩。梅陇中学质量立校创特色 面对竞争越来越严峻的办学形势和生源综合素质较差的实际，海丰梅陇中学提出“不求人人上大学，先求个个健康成长”的教学思路,加强师德教育。
加强常规管理，加大教研的力度，对内挖潜，外争生源，分层教学，分类培养，努力提高教育教学质量。该校强化“质量立校”的意识，实施教研兴校战略，每位行政领导下到各科组挂点指导工作。每次教研活动都做到有计划、有内容、有记录、期末有总结。学校实行每学期的公开课、优质课比赛、说课比赛、优秀论文评选、课件制作评比制度化。