出入境报检的主要程序如下：
入境货物的检验检疫工作程序是:报检后先放行通关，再进行检验检疫。出境货物的检验检疫工作程序是:报检后先检验检疫，再放行通关。
入境货物的检验检疫工作程序是：
申请报检--受理报检--办理通关--实施检验检疫--放行。法定检验检疫入境货物的货主或其代理人首先向卸货口岸或到达站的出入境检验检疫机构申请报检;提供有关的资料。检验检疫机构受理报检，审核有关资料，符合要求，受理报检并计收费用转施检部门签署意见，计收费。
对来自疫区的、可能传播传染病、动植物疫情的入境货物交通工具或运输包装实施必要的检疫、消毒、卫生除害处理后，签发《入境货物通关单》(入境废物、活动物等除外)供报检人办理海关的通关手续；
货物通关后，入境货物的货主或其代理人需在检验检疫机构规定的时日和地点到指定的检验检疫机构联系对货物实施检验检疫。经检验检疫合格的入境货物签发《入境货物检验检疫证明》放行，经检验检疫不合格的货物签发《检验检疫外理通知书》，需要索赔的签发检验检疫证书
出境货物的检验检疫工作程序是:
报检后，先检验检疫，后通关放行”。第一个步骤:报检；第二个步骤:受理报检。
法定检验检疫的出境货物，在报关时必须提供出入境检验检疫机构签发的《出境货物通关单》，海关凭报关地出入境检验检疫机构出具的《出境货物通关单》验放。
申请报检——受理报检——实施检验检疫——出具《出境货物通关单》或《出境货物换证凭单》——放行
出境货物报检的种类：出境一般报检，出境换证报检，出境货物预检报检
出境货物报检的地点和时限
出境货物最迟应在出口报关或装运前7天报检，对于个别检验检疫周期较长的货物，应留有相应的检验检疫时间；需隔离检疫的出境动物在出境前60天预报，隔离前7天报检；法定检验检疫货物，除活动物需由口岸检验检疫机构检验检疫外，原则上应坚持产地检验检疫。