清朝能统治蒙古具体如下。
①称蒙古大汗，宣称直接继承了蒙古帝国法统；
②奉黄教，笼络蒙古各部的宗教势力（据现有史料记载，雍正、乾隆两帝似乎不信教，对萨满、佛教、基督均视作迷信，但政治上采取实用主义）；
③对战略要点建城并驻军，由各路将军统辖。
④对蒙古基层采取盟旗制，离散部落、齐民编户。
盟旗制大体如下
清对归附的蒙古部众，按盟旗原则重新安置归附的蒙古诸部，直至全蒙古部众悉数被纳入盟旗体制。
其中，旗是清廷设在蒙古地区的基层行政单位，在法理上是清朝皇帝（也就是蒙古大汗）赐给旗主的世袭领地。旗经过编织佐领，安置属民，分给牧地，划定旗界，通过任命札萨克（执政官）而形成。
盟为旗的会盟组织，合数旗而成。每盟设正副盟长各一人，由清帝派人兼摄。盟长的主要任务是充当三年一次的会盟召集人，履行比丁、练兵、清查钱谷、审理重大刑名案件、监督属下各旗等职责，但无发兵权。
同时，清代严格限制各旗属民越旗游牧、耕种、往来、婚嫁。
盟旗制下，蒙古诸部的经济基础实质上已从游牧制转变成畜牧制，实现了人口土地紧密结合，方便清廷统治。
至此，蒙古旧地被分割成内属、外藩共计262旗。其中外藩蒙古各旗主的权柄已形同西南土司，而内属蒙古甚至已经实现“改土归流”，由清帝直接派遣旗主。有清一代，牧区再也无法自发形成新的权力中心，或者说，清廷成功把自己打造成了蒙古高原的新核心。
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