车辆违章在交通管理部门办理。
因为现在还没有实现全国联网的异地违章处理，所以车辆不管是在什么地区违章，都必须在车辆年检之前，到车辆所在地的交通管理部门进行违章处理并扣分，如有罚款需要到指定违章缴费银行办理，不然车辆不能进行年检。
扩展资料：
反交通信号的违法行为严重扰乱道路交通秩序，不仅危害大，而且导致交通事故的几率和导致人员死伤的几率高，一直以来是公安交管部门管控的重点交通违法行为。2012年上半年，全国公安交管部门共查处因驾驶机动车闯红灯交通违法数量比2011年上半年上升32.5%。
2011年，全国因闯红灯导致的交通事故共4768起，造成1175人死亡。按照《道路交通安全法》规定，对驾驶人违反交通信号的行为，处警告或者20元以上200以下罚款，同时予以记分。公安部123号令规定，对违反交通信号的驾驶人的记分分值，由一次记3分调整为记6分。