日本的起源是源于中国。
公元五世纪大和国统一日本，移民大抵是黄皮肤的黄种人，主要由在日本弥生时代（公元前300年－公元250年）扶余人、汉族以及阿尔泰语系民族与日本列岛本土的绳文人融合而成。
自东亚大陆漂洋过海而来的外来移民沿着朝鲜半岛而下，渡过海峡，登上了这个位于东亚尽头火山密布的列岛。
国名
日本，最早称“和”或“倭”（均读作yamato，中文译作邪马台），“日本”这一称呼大约使用于7世纪后期。其来历在日本史书中没有明确记载。
中国的《新唐书》中记载：唐高宗咸亨元年（670年），倭国派使者祝贺唐朝平定高句丽，因为懂点汉语，所以讨厌“倭”这一名称，故改国号为日本，使者自称这是因为地理位置靠近日出之处而命名的。
朝鲜《三国史记》文武王十年（670年）十二月条的记录也与此吻合：“倭国更号日本，自言近日所出以为名”。唐朝人张守节则记载“武后改倭国为日本国”。
如下：
起源一、从西伯利亚迁移的原始人
大约在公元前2500年，已经有来自西伯利亚的原始人从亚洲大陆穿越到日本北海道。从日本最早的人类遗迹中，可以发现这是一个能够生产石器但仍然靠狩猎和采集为生的钻石社会。
这个原始社会因为陶器的绳索设计而被称为【绳纹文化】，它与西伯利亚东部的考古发现有相似之处。据考古学家的DNA研究中，通过检测非常大的样本数量得出结论，认为现代日本人的绳纹血统仅为平均水平的3％，也就是说土著人的后裔数量在日本已经很少了。
北海道土著人对现在日本人文化的影响很小，甚至不存在。 因为日本人与其他现代东亚人在基因上有着密切的联系，并且明显不同于北海道土著人。
起源二、从东南亚迁移的弥生人
在大约公元前250年，日本发现了另一个新石器时代的社区，它被称为弥生文化，首先在东京的街道上被发现的他们最早的痕迹。
这些人已经会种植水稻，因此被认为是从东南亚沿着琉球群岛到达日本的。现在，日本人大多数的祖先是弥生人，是原始的日本人，他们将日本文化及其语言带到了日本和琉球群岛。
通过基因研究，我们知道现代日本人与当地的原始人中只有3％的DNA相似。而现代日本人与古代弥生人的DNA相似度高达80%，这种强大的遗传差异意味着弥生岛在很大程度上取代了当地的原始人。
例如在北海道的日本原始人直到明治维新后才被完全并入日本，此后日本定居者(弥生人后代)对该岛进行了殖民，并且人数迅速超过了当地原住民。
起源三、从中国与朝鲜半岛移民过去的
大家知道，现在日本作为一个多血统人中融合的一个国家，却只有一个民族：大和民族。在弥生时代，来自东亚的山东半岛与朝鲜半岛的人也移民到了日本，和当地的弥生人融合，形成大和民族。来自东亚的移民是长期性的，从春秋时代到三国时代，原因出乎一致：躲避战乱与寻找生存空间。
从东北亚迁移到朝鲜半岛之后，弥生族开始在日本定居并统治日本。首先是九州、四国和本州南部，最后迅速取代了人数众多的土著部落，并开始扩大大和王国。
从东北亚移民过去的人还向日本带来了儒家文化，现代日本神道很大程度上是从儒家文化传统演变而来的。日语是约公元800年前后从朝鲜半岛到达日本的，弥生人在那里创造了他们的文化，来自东北亚的移民为日本带来了相似的语言生态和稻作农业。
结论：
如前所述，日本人的起源是多民族是众所周知的，但是现在也无法知道弥生人的确切起源。有一些理论认为弥生人是从中国移民的，但弥生人又与朝鲜人、蒙古人、东南亚人等有联系。
目前普遍认为日本人起源于两个地方，居住在日本北海道原住民：绳纹人，他们是靠狩猎采集者，是由不同的部落组成的。另外一个起源是东北亚经朝鲜半岛、东南亚经琉球群岛移居到日本的弥生人，他们带来了稻作农业与儒家文化。这两类人融合在一起，形成了一个新的种族：大和民族。
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