摩托车发动机故障灯亮的原因可能有多种，以下是其中两个常见的原因：
1. 火花塞有积碳：当摩托车发动机使用一段时间后，火花塞上会积累一些积碳，这些积碳会导致发动机出现损害、启动困难、加速不良、发动机噪音过大等现象。积存的热量会导致发动机无序点火，从而引发发动机爆震，进而导致发动机故障灯亮起。
2. 燃油质量问题：有些车主在不规范的加油站加了质量差的油，导致燃油品质不达标，从而引发发动机故障灯亮起。燃油品质差会导致发动机工作不稳定，影响发动机的正常工作，严重时甚至会导致发动机损坏。
以上是摩托车发动机故障灯亮的两个主要原因，如果遇到这种情况，建议及时检查火花塞和燃油质量，以避免更严重的损坏。同时，建议定期对摩托车进行保养和维护，确保摩托车的正常运行。