南京工业大学经济与管理学院在科研领域拥有强大的实力。学院与江苏省科技厅紧密合作，依托江苏省科技创新协会和江苏省知识产权局的挂靠，展示了其在科技创新和知识产权人才培养方面的领先地位。学院内设有多个特色研究所，如技术创新与产学研合作研究中心、区域知识产区战略研究所、中小企业研究所、金融研究所等，涵盖了产业经济、制度经济学和技术经济等多个方向。
与企业界的紧密合作进一步提升了学院的科研能力，与南京朗坤软件有限公司、天地龙集团和鑫信投资担保集团共建了研究创新中心、教学实践基地和研究生工作站。学院在国家级和省部级科研项目上屡有斩获，包括主持和参与的课题数量逐年增加，多项成果荣获省部级科技进步奖等重要荣誉。学院教师在国内外权威期刊如《经济研究》、《管理世界》、《金融研究》等发表论文逾百篇，部分论文被SCI、EI和新华文摘收录，出版的专著和教材数量也颇为可观。
学院的社会服务工作同样出色，江苏省中小企业培训服务中心和中国化工学会技术经济与管理现代化委员会教育培训部均设在学院内。作为江苏省工商管理人才资格培训定点单位和IPMP认证江苏考点，学院已培养了众多经济管理人才，为南京市政府、江苏省科技厅、知识产权局等政府机构以及扬子石化、宏图高科、雨润集团等企业提供专业的管理咨询服务，为地方经济发展做出了积极贡献。
南京工业大学经济与管理学院的前身可溯源于1958年原南京化工学院独立建校时成立的文科教研室；1979年开始招收经济管理类学生，1980年建立相应的人文和经管系科；1999年1月成立南京化工大学经济管理学院。2001年原南京化工大学和原南京建筑工程学院合并组建南京工业大学，对人文、经管和法律等相关学科进行整合，成立了经济管理学院和管理科学与工程学院。2010年8月，整合原经济管理学院和管理科学与工程学院相关学科，组建了新的经济与管理学院，由赵顺龙教授担任院长。