辽宁大学的日本研究所是一个专业研究机构，拥有16名专职和兼职科研人员。这个研究所设有多个专业研究室，包括日本经济研究室、日本文学研究室和日本历史研究室，以及图书资料中心和《日本研究》杂志社等。
日本经济研究室专注于深入研究日本的经济体制及其与中国的经济关系，其研究领域广泛，力求揭示两国经济互动的深层次规律。日本文学研究室则聚焦于中日比较文学，探讨日本文学的不同流派，以及重要作家和作品，为理解两国文化的交流提供重要视角。
日本历史研究室则主要关注中日关系的历史变迁，尤其是中国东北地区与日本的历史联系，通过历史研究，为当前和未来的中日关系提供历史借鉴和理论支持。
图书资料中心是研究所的重要组成部分，藏书丰富，总计有4万余册的日文图书，以及50余种日文杂志，这使得辽宁大学日本研究所成为我国东北地区最大的日文图书资料中心，为研究人员和学者提供了丰富的学术资源。