基因序列拼接好之后，找不到完整的ORF，好像是提前终止了，基因断裂了很多部分，哪位帮帮忙解决一下？跪谢

如题所述

举报该问题

第1个回答 2011-07-15

难道是找到新的可变剪切（transcript variant）了？追问

不知道啊，不太可能吧，我觉得可能是突变或其他原因造成的，请问你身边有没有这方面的高手，请教请教啊！急死了都！！！

追答

重新挑几个clone再测一下~

追问

谢啦，我本来就送了好几个测的，估计是我没拼接好！

相似回答

目前对核酸序列分析中用于查找orf的方法有哪些答：1.基于序列相似性的方法：这类方法利用已知基因的序列相似性来寻找新的同源基因。通过比对已知基因序列与新序列，可以识别出与已知基因类似的潜在ORF。这种方法依赖于已有的基因数据库和生物信息学工具，如BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）等。2.基于基因模型的方法：这类方法使用预测基因模型的算...

什么是ORF?答：1、开放阅读框（英语：Open reading frame；缩写：ORF；其他译名：开放阅读框架、开放读架等）是指在给定的阅读框架中，不包含终止密码子的一串序列。2、这段序列是生物个体的基因组中，可能作为蛋白质编码序列的部分。基因中的ORF包含并位于开始编码与终止编码之间。3、由于一段DNA或RNA序列有多种不同...

怎样快速找到基因序列的开放阅读框答：可以先到NCBI的数据库去找，里面会有基因的详细信息，有一些软件分析的时候也会给出已知的基因的ORF。如果没有就要自己分析了，一般是有ATG作为起始密码子，在这个ATG前有3种终止密码子中的一个。

基因序列中的一些名词区别(CDS、Exon、Intron、UTR、ORF、启动子、TF等...答：2. 外显子（exon），如同舞台上的演员，它们在剪接后保留下来，直接参与到蛋白质的生产过程中，是生物体生命活动的关键蓝图。编码区的解读3. 开放阅读框（ORF），乍看似乎简单，实则复杂。它理论上是蛋白编码的区域，但寻找起始和终止密码子的自动化过程可能带来误解，因为DNA序列的解读并非一目了然。4...

生物系统建模名词解释答：一般认为,蛋白质有四级不同的结构.研究蛋白质结构和预测的理由是:医药上可以理解生物的功能,寻找dockingdrugs的目标,农业上获得更好的农作物的基因工程,工业上有利用酶的合成.直接对蛋白质结构进行比对的原因是由于蛋白质的3维结构比其一级结构在进化中更稳定的保留,同时也包含了较AA序列更多的信息.蛋白质3维结构...

开放阅读框(open reading frames, ORFs)是什么?答：orf与基因的关系 orf是完整基因序列的一部分，一个完整基因包括orf序列以及非编码序列。orf可作为一个潜在蛋白质编码基因的指示器，但是预测的orf并不一定是基因。例如，一个典型的细菌基因组中已注释基因的数目远低于ORFs数目，前者约10 3 至10 4 ，而后者可达到10 4 至10 5 [2]。很好理解，...

解释CDS、cDNA、EST、mRNA、ORF间的区别?答：ORF是理论上的氨基酸编码区，一般是在分析DNA核酸图谱中（主要是利用电脑程序）得到的。程序会自动在DNA序列中寻找启动因子（ATG或AUG），然后按每3个核酸一组，一直延伸寻找下去，直到碰到终止因子（TAA或TAG）。程序把这个区域当成ORF区，认为理论上可以编码一组氨基酸。但问题是，在一个整体核酸序列中...

大家正在搜

dnaman序列拼接为啥拼接不了如何确定一段序列是一个基因基因序列与dna序列基因序列是什么基因序列分析如何查找基因序列如何确定基因的调控序列基因序列在哪里查询 ncbi怎么下载基因序列

转录组数据拼接出一个完整的orf，能确定他就是完整基因吗

怎么分析dna序列中终止密码是否提前

没有完整的ORF是完整的基因么？如何设计引物

请教ORF 和 gene 的区别

ORF是否等同于基因的编码框？

如何利用生物信息学确定某基因完整ORF区

关于基因预测结果的整合与否

分子生物学中的CD是指什么？ORF又是什么？