据国内有关食用菌专家分析，当今食用菌业的发展方向趋于以下几个方面：
（1）品种多样化
目前，我国规模栽培的食用菌有20余个品种，近年来还有些新品种驯化栽培成功。要在目前品种结构基础上，积极推广具较高经济价值和市场潜力大的新品种。
（2）资源持续化
要加强森林资源的保护，发展菇耳专用林，充分利用果、桑业下脚料及农作物秸秆，扩大袋料栽培；通过对食用菌营养生理及原料成分的分析，研究合理的栽培配方，促进农业的可持续发展。
（3）菌种优良化
我国食用菌生产仍存在“重产量、轻质量”的倾向，致使一些食用菌产品在国际市场上缺乏竞争力。同时，在菌种选育方面的科研力量较为薄弱，生产品种的更新换代相对缓慢。加快优质、高产、抗病、抗虫、耐贮等优良菌株的选育，是提高产品质量的必由之路。要不断通过国际交流，引进国外新菌种和先进的育种技术，并开展野生菌种的驯化研究，研究有我国知识产权的菌种。
（4）生产规模化
食用菌生产将由传统的家庭副业向产业化、集约化转变，采用合作经营方式，扩大生产规模。有条件的地区要搞“一乡一品”，走“公司＋基地＋农户”的路子，有实力的企业可进行工厂化栽培。统一供应原辅料、统一培育供应菌种、统一加工流通，形成规模优势，提高市场综合竞争力。
（5）质量标准化
产品的市场流通要与国际市场接轨。菌种和产品质量都要按照行业标准进行检验，菌种要实行生产和经营许可证制度；产品要进行注册商标，零售要有包装，树立品牌意识。
（6）管理严格化
栽培管理要有技术操作规程，尤其要加强预防杂菌污染和对生产投入品的限制，每个环节建立责任制，严格管理。
（7）加工增值化
加大对食用菌加工产品的研发力度，大力发展精深加工，实现增值，向保健食品、药用品方向开拓新产品。
（8）市场网络化
主产地区培育食用菌加工龙头企业，出口创汇；产区建立专业交易市场，在销往地城市建立批发、仓储公司，在菜市、超市设立食用菌专柜，健全信息与市场体系。
（9）菇餐大众化
广泛宣传食用菌的营养及食疗价值，开设食用菌专业餐馆、连锁店，在饭店餐馆有食用菌菜谱，食用菌进入家庭餐桌，扩大消费。
（10）贸易国际化
加强国际交流与合作，大力开拓国际市场，扩大产品出口创汇，还可以到国外办菇场。