根据市机构编制委员会“关于印发合肥市粮食局主要职责内设机构和人员编制规定的通知”（合编[2010]40号）精神，市粮食局设5个内设机构，内设机构及职能如下：
一、办公室(主任：崔扬)
负责机关文秘、会议、机要、档案、信息、保密、接待、安全保卫工作；负责机关车辆管理等后勤服务工作；负责机关、直属单位机构编制、人事管理和离退休人员的服务管理工作；负责人大代表、政协委员的提案、议案办理；负责信访稳定工作；负责综合协调和联络工作。
二、计划财务处（处长：刘庆银）
会同有关部门管理和监督粮食风险基金的使用；拟订市级储备粮的财务管理制度并监督执行；负责市级储备粮的财务审计和监督，定期审核资产、负债和损益，负责编制汇总财务会计报表；负责政策性粮食的各项补贴的拨付、清算和使用监督；承担部门预算和有关财务管理工作；负责直属单位国有资产监管工作，推动全市国有粮食企业改革和发展。
三、调控处（监督检查处）（处长：罗春）
拟订全市粮食宏观调控、总量平衡以及粮食流通的中长期规划、地方粮食储备计划；提出市级储备粮的规模、总体布局以及收储、轮换和动用建议并负责组织实施；承担全市粮食流通监测预警和应急管理工作；指导协调国家政策性粮食购销工作，协调产销区粮食余缺调剂；指导和帮助解决灾区、库区移民和缺粮地区的粮食供应，安排以工代赈和国家、省、市重点建设项目粮食供给；负责粮食收购准入的审核、报批和发证工作；负责军粮供应和粮油信息管理工作；负责全社会粮食行业统计工作。
负责监督检查有关粮食管理的法律、法规和政策执行情况；负责对市级储备粮计划、质量和粮食流通统计制度执行情况的监督检查；监督检查粮食经营者购销活动、粮食质量、粮食仓储设施和设备等；依法对违反有关规定的行为进行处罚。
四、仓储处 （处长：徐章海）
提出全市粮食仓储、加工和粮食流通设施建设规划的建议；组织实施粮食储存、运输的技术规范，指导全市安全储粮工作；负责市级储备粮的库存管理和质量安全；拟订粮食购销进出库的质量检验制度；负责市级储备粮储存资质审查；承办粮食流通仓储设施项目投资有关工作。
五、行业管理处（政策法规处）（处长：夏光海）
负责全市粮食流通的行业管理；拟订全市粮食行业发展规划并组织实施，指导粮食产业化发展；指导粮食行业的技术改造和新技术推广；指导粮食行业安全生产工作；联系全市粮食行业协会工作。
拟订全市粮食流通体制改革方案并组织实施；提出全市粮食流通产业发展战略的建议；拟订全市粮食管理地方性法规、规章草案和规范性文件；组织制定有关粮食企业的经营资格条件、最低和最高库存量标准；负责粮食行政执法、行政复议和行政诉讼；承担全市粮食行业法制宣传教育等工作。
纪检（监察）机构、机关党组织及群团机构设置按有关文件规定执行。
