中国境内可进行同位素分析的实验室至少有数百个，举例如下：
中国科学院同位素年代学和地球化学重点实验室。该实验室成立于2004年，其前身是奠定我国元素和同位素地球化学研究基础的第一个稀有元素矿物化学实验室（1956年）和第一个同位素绝对年龄实验室（1960年）。实验室依托“地球化学”、“矿物学、岩石学、矿床学”、“构造地质学”和“环境科学”等4个具有博士学位授予权的二级学科，定位于基础研究，致力于发展同位素和元素地球化学理论和技术方法，揭示地球内部和浅表地质体的物质组成及演变规律，深化对地球形成演化、地球各层圈相互作用以及各种地质过程的认识，阐明其对矿产资源形成和环境变化的制约，为解决资源环境领域重大科学问题提供理论依据。
中国科学院地质与地球物理研究所环境同位素实验室。该实验室具有MAT 253气体同位素比值质谱，并配备有Flash EA 1112型元素分析仪、TC/EA高温裂解转化装置、Trace GC 2000型气相色谱仪和GasBench II型碳酸盐反应装置。这些外设可以与MAT 253气体同位素比值质谱联机工作，从而实现在线测定固体或液体样品中C、N、H、O等稳定同位素比值，有机单化合物的C、N、H、O同位素比值和碳酸盐中的C、N同位素比值。
中国农业科学院农业环境稳定同位素实验室。该实验室主要从事环境稳定同位素的方面的研究工作，包括水体硝酸盐污染物溯源研究；温室气体CH4、CO2、 N2O同位素特征；有机食品同位素规律；硝化与反硝化作用 N2O的 α、β同位素特征等。开发针对不同研究的同位素测定技术研究，例如水体反硝化作用氮氧同位素的测定技术、水体DIC同位素测定方法、土壤硝态氮与铵态氮的同位素测定技术。同时开展一些同位素测定服务工作，可以分析的元素包括H、C、N、O和S的稳定同位素。
国土资源部同位素地质重点实验室。该实验室由中国地质科学院地质研究所和矿产资源研究所共建而成，该实验室的前身为中国地质科学院同位素地质实验室，成立于1958年，是国内最早建立的同位素地质实验室之一。1990年成为原地质矿产部同位素地质开放实验室，2003年改名为国土资源部同位素地质重点实验室。
