社团管理指导委员会由多个核心部门组成，共同协作，确保社团的有序运营和良好发展。
团工委作为领导组织，由校团委指导，负责党的理论教育和社团与校团委的联系。主要职责包括定期召开例会，听取意见，策划和总结社团活动，坚持公平、公开、公正原则，参与社团换届和党员发展工作。
秘书处主要负责社团活动的申报与监督，包括条例执行、财务监管、投诉处理和会议记录，确保工作的有效进行。
组织部则聚焦内部活动策划和社团间协调，监控社团活动实施，并向秘书处汇报情况。
宣传部运用各种资源，为社指委和社团宣传政治、文化活动，管理宣传材料和展示板。
外联部负责与校内外其他组织的联络与合作，促进校际间的交流与互动。
网络部掌管社指委和社团的网络平台，利用网络征求意见，发布新闻和信息。
编辑部负责社联刊物和新闻稿的编辑与审核，指导社团的出版工作。
社团服务部承担关键的行政管理任务，包括社团成立与注销、招新、会员管理、活动审核、年度计划与总结等，确保社团活动的规范、有序和有益。