1.用途不一样
MOV格式
即QuickTime影片格式，它是Apple公司开发的一种音频、视频文件格式，用于存储常用数字媒体类型。也可以说MOV是苹果公司发布的一款全新编码的视频格式。MOV格式可以用苹果系统的Quicktime软件进行播放。另外苹果的手机iPhone、平板电脑iPad都支持自己的MOV格式播放。这么优秀的视频格式，现在很多播放器也开始支持播放，比如暴风影音、QQ影音、风行软件都可以播放。
MP4格式
MP4格式是为移动终端设备而生的格式，MP4格式主要用在各种移动平台上，比如三星手机、iPhone、iPad、一些DVD设备都支持MP4视频的播放。
2.文件大小、画质不一样
avi、mp4、rmvb相比起mov文件体积要小得多，前几种格式压缩率相比后者要大得多，虽然相对来说更省存储空间，但画质将会受到影响，很不利于后期编辑和制作，尤其是后期特效和调色。这一点很像数码相机的RAW格式和jpeg格式，前者为无损压缩格式后者则是有损压缩格式，前者的后期调整余地更大。这也是很多资深的摄影者更愿意用前者拍摄的原因。很多广播级的数码摄像机的码率都在24M左右，数码单反（全幅）也都在80~90M左右，电视台拍摄电视剧用的专业级数码摄相机每秒都达到500M左右。
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拓展资料：
MOV是一种大家熟悉的流式视频格式，在某些方面它甚至比WMV和RM更优秀，并能被众多的多媒体编辑及视频处理软件所支持，用MOV格式来保存影片是一个非常好的选择。
MOV格式文件是以轨道（track）的形式组织起来的。一个MOV格式文件结构中可以包含很多轨道。轨道的数目限制有一些经验值，这些值会因为计算机的能力越来越强大而发生改变，然而MOV格式文件本身并没有预定义的轨道数目限制。
参考资料：/baike.baidu.com/item/MOV/213982?fromtitle=MOV%E6%A0%BC%E5%BC%8F&fromid=484997&fr=aladdin"target="_blank">MOV-百度百科，/baike.baidu.com/item/MOV/213982?fromtitle=MOV%E6%A0%BC%E5%BC%8F&fromid=484997&fr=aladdin"target="_blank">MP4-百度百科