1911年，布吉站随著广九铁路华段（即今广深铁路）建成同时启用。而深圳布吉火车站也是广深铁路双线改造及准高速改造施工时唯一没有同时进行站房扩建的车站。
该站于1911年启用，目前由广州铁路（集团）公司（简称广铁）广深铁路股份管辖，没有任何旅客列车停靠或始发。根据深圳市《深圳地区铁路运输总图规划》和《深圳市铁路第二客运站交通规划》，深圳北站投入使用以及布吉站改造完成后，布吉站将会是深圳「二主三辅」铁路车站中的「一辅」(辅助客运枢纽)，并且深圳地铁龙岗线和环中线的布吉站在此换乘和交汇。
更名
从2012年12月5日起，广深铁路布吉站更名为深圳东站。今后投入运营的深圳东站将由深圳火车站负责管理。深圳东站功能定位仅次于深圳火车站、深圳北站，投入运营后，深圳东站将主要开行普速长途列车，是深圳市“两主三辅”火车站之一。
深圳东站于1911年建成使用，至今已有101年历史，将成为深圳地区第三大铁路客运枢纽，是深圳布吉综合客运枢纽的重要组成部分。目前，该站候车大厅面积约7100㎡，共设3个售票厅。
龙岗大道“布吉地铁站”公交停靠站站名变更为“深圳东站”。途经龙岗大道的300线等26条公交线路和深惠3A线按照新的站点名称组织运营。西部公汽公司322、383等2条公共汽车线路和东部公交M233公共汽车线路增加一对“深圳东站”公交停靠站。
3号线（龙岗线）、5号线（环中线）原“布吉站”站名变更为“深圳东站”。由于，深圳不少市民也习惯把位于坪山的在建火车站称为“深圳东站”。为避免信息紊乱，更好地指引市民搭乘公交、地铁前往深圳东站，深圳市交委启动公交站名、地铁站名的变更工作，并尽快完成相关站台、站牌的信息变更，以准确指引市民出行。
改造
布吉火车站已经改造完成，于2012年12月21日完工并投入使用，布吉站将承担深圳的普通长途列车的终到和始发，未来几年，厦深铁路建成通车之后，布吉站也可能会承担一些厦深铁路过来的列车的终到和始发。现有的深圳站（也叫罗湖站）将主要是承担广深城际和谐号和广东省内的列车终到和始发。深圳西站在布吉站投入使用之后会慢慢的逐步退出目前的客运功能，恢复原来的全货运火车站。深圳北站将是承担广深港高铁和其他高铁列车的终到或过路和始发。前往香港的出境列车在深圳北站是过路的。
设施
其中站房面积约2.6万平方米，设计站台4座，股道11条，其中广深铁路线正线4条
时刻表
车次
车型
始发站
始发
到站
开出
终点站
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K556
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武昌
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K92/K93
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K94/K91
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14:16
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深圳西
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K9076
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常德
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K1620
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天津
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怀化
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16:06
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济南
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K1232/K1234
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南宁
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19:42
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K2056
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13:30
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T8374
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广州
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K92
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K1208/K1205
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19:42
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