国立虎尾科技大学的校名争议，围绕其英文名"National Formosa University"展开。一些人质疑中文校名与英文名不符，认为"Formosa"象征台湾全岛，带有殖民色彩，不适合区域性大学。虎尾科大的支持者则认为，英文名富有前瞻性，且学校地理位置重要，可代表台湾岛中心，同时融合了虎尾和福尔摩沙的特色。
自1997年校名改为"国立虎尾技术学院"以来，反对声音不断。学生和校友担忧校名变化导致学校地位下降，影响其声誉和发展。云林工专的声誉因改名而受损，而虎尾科大则被误解为与云林工专无关。2004年改名"国立虎尾科技大学"后，校名问题依然存在，校友们强烈要求恢复原来的大地名"云林"，或是将科技大学改为其他形式，如"云林工业大学"、"云林理工学院"或"云林第一科技大学"。
2006年，国立台北科技大学的改名运动促进了虎尾科大校友会的活跃。校方进行问卷调查，大部分学生支持回归"云林"，但由于"云林科技大学"的存在，只能改变"科技大学"部分。合并运动也在讨论中，由于云林县缺乏综合型大学，"教育部"提出合并两校的计划，以整合资源。然而，合并案因科系重复和资源重叠引发争议，目前两校已成立并校小组，探讨如何扩大教育规模。
“国立”虎尾科技大学（英语：National Formosa University，NFU）是一所坐落于台湾省云林县虎尾镇的“国立”科技大学，常被简称为“虎尾科大”、“虎科大”或“虎科”。因应台湾发展精密工业之需求，故奉台湾地区“教育部”之令于1980年7月创校，以原虎尾高中校地多次改建而成。虎尾科大紧临虎尾糖厂、安庆国小与虎尾溪，校园周遭因而留下不少台湾日治时期的建筑古迹。
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