邵东县房产管理局内部结构详细划分，设有6个职能股室，包括：
办公室：负责日常行政管理工作。
财务审计股：掌管财务和审计事务。
房政股（产权产籍管理股）：专注于房产产权和产籍管理。
法规股（加挂邵东县人民政府房屋拆迁管理办公室）：负责房产法规及拆迁管理工作。
城镇住房保障工作管理办公室：关注城镇居民住房保障事务。
此外，该局还设有7个局属二级事业单位：
房地产交易管理所：处理房产交易事务。
房产测绘队：负责房产测绘工作。
白蚁防治站：维护房产免受白蚁侵害。
房屋拆迁事务所：负责拆迁相关事宜。
住房维修专项资金管理中心：管理住房维修资金。
房地产价格评估管理所：进行房地产价格评估。
房地产开发总公司：负责房地产开发项目。
2006年，房产管理局设立了政务中心房产分中心，引入无纸化办公，实现了“一个窗口受理”和“一条龙服务”，显著提升了办事效率和服务质量。其房产档案管理更是颇具规模，拥有一个省级三级档案室，配备了先进的档案密集架，目前存有超过10万册的产权产籍民生档案。这些档案已实现微机管理，处于全市房产档案管理的领先位置。