南阳医学高等专科学校图书馆的建立源于南阳卫校图书馆、张仲景国医学院图书馆与南阳第一职业技术学校图书馆的整合。这个图书馆目前拥有一个中心馆和两个分馆，分布在新老两个校区，总共设有2600多个阅览座位，占地面积达到了18835平方米。图书馆的工作人员队伍由44人组成，其中包括馆长1人、副馆长2人，以及4位部门主任和37位一般工作人员。他们大多具备本科及以上学历，其中2人拥有硕士学位，20人具备中级职称，专业领域涵盖了图书馆学、信息管理、医学、经济管理学和文学等多元化领域。
图书馆致力于现代化建设，以“自动化、网络化、数字化”为主要内容，已达到较高的服务水平。资源管理和服务模式开放，便于师生访问。馆内藏书丰富，纸质文献资料总量达到86万册，每位学生平均拥有101册，确保了充足的学习资料。此外，图书馆还引进了5个数据库，自建中西文图书和期刊目录数据库近13.7万条，形成了以医学为主，兼顾德育、文体等多学科的文献资源体系，有力支持了学校的教学、医疗和科研活动。
随着网络技术的发展，图书馆不断加大电子资源的投入，目前拥有清华大学的清华同方数据库和超星数字图书馆等专用数据库，这些资源均通过校园网提供，为全校师生提供了随时查阅和检索的便利条件。
南阳医学高等专科学校的前身是创办于1951年的南阳卫校，2004年经国家教育部批准升格。2006年南阳市委、市政府对南阳医学教育资源进行整合，委托南阳医学高等专科学校对南阳中医药学校、南阳理工学院国医国药系（原张仲景国医大学）、南阳市一职专实行“五统一”代管，形成了以西医为主体、中医为特色、中西合璧、优势互补的办学格局。