检察机关的询问笔录，最终的去向，当然是移送到人民法院。
一、检察机关办理的案件有二块。
1、贪污贿赂或渎职侵权的案件，这一类案件统称为职务犯罪案件，由检察机关自己侦查；
2、其他的刑事案件，由公安机关或国家安全机关侦查。
二、任何案件侦查终结后，如果不是撤案的，都要先移送到检察机关审查起诉。
在这个阶段，检察机关仍然可以询问证人，跟侦查阶段检察机关做的笔录一样，如果案件需要，这些笔录会统一编录到一本本的卷宗里，最终都会移送到人民法院，以证明相关人员有罪或无罪，或罪重罪轻等。
当然，一个案件也可能会撤案或不起诉处理，如果是最终不起诉的，那询问笔录就不移送到人民法院了，就保留在检察机关；如果是撤案的，案件卷宗最终是由公安机关保管的。
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