上海市动物防疫条例（2010年修正）的第三章主要规定了动物疫病的控制和扑灭措施。首先，市兽医主管部门负责统一管理本市动物疫情信息，按照国家制度发布疫情，根据国务院授权进行相关公告（第十六条）。
区、县人民政府需要根据本地实际情况制定重大动物疫情应急预案，并报上级兽医部门备案，同时组建由兽医、卫生、公安等专业人士和专家组成的动物防疫应急预备队，定期进行应急控制和技术演练（第十七条）。
针对不同动物疫病，市和区、县兽医部门需根据政府预案制定实施方案，强调相关单位和个人在动物疫情报告和监测上的责任（第十八条）。一旦发生重大动物疫情，政府将设立应急指挥部，统一指挥应急工作，划定疫点、疫区和受威胁区，实行封锁（第十九条）。
疫区封锁期间，政府会采取一系列措施，如设立警示标识、实施动物扑杀和消毒等，以控制疫情扩散（第二十条至第二十二条）。如果因疫情处理造成损失，政府将给予合理补偿（第二十三条）。
在疫情结束后，封锁解除需满足特定条件，如所有染疫动物和产品处理完毕，且监测无新发病例，相关场所经过消毒后，由原发布封锁令的政府宣布并通报周边地区（第二十五条）。
《上海市动物防疫条例》经上海市第十三届人民代表大会常务委员会第十九次会议通过，自2010年7月1日起施行。为了加强对动物防疫工作的管理，预防、控制和扑灭动物疫病，保障养殖业生产安全，保护公众身体健康与生命安全，维护正常的社会秩序，依据《中华人民共和国动物防疫法》、《重大动物疫情应急条例》等法律、行政法规，结合本市实际，制定本条例。