菠萝蜜籽的正确吃法是炒着吃、煲汤或煮粥。
将菠萝蜜籽煮熟后，用小火翻炒至炒熟，就可以像吃栗子一样剥着吃了。菠萝蜜籽还可以煮粥，将菠萝蜜籽去皮洗净与米一同下锅煮粥，口感软糯。此外，菠萝蜜籽还可以用来煲汤，只需将核取出后放入汤锅中与其他备好的食材一起煮，汤汁鲜美浓香。
在吃菠萝蜜籽之前，也就是在煮菠萝蜜籽之前，可以先把菠萝蜜核放进盐水中泡几分钟。这样做不仅可以避免吃菠萝蜜核而产生过敏反应，而且还可以使果肉更加美味。需要注意的是不可以吃太多菠萝蜜籽。
菠萝蜜的物种分类
中国将菠萝蜜为干苞和湿苞2种类型，其他国家对菠萝蜜的品种分类与中国类似，基本上也分为2类：
1、软肉型（Soft flesh,soft jackfruits）。果实完全成熟后，能徒手剥开；肉甜，质软，果汁多。
2、脆肉型（Firm flesh,hard jackfruits）。果皮不易徒手剥破，需用刀来剥开果实；果肉硬而脆，甜度变化较大。