首次提出“人类非洲起源假说”论的，应是生物学家查尔斯·罗伯特·达尔文，他在1871年出版的《人类的由来及性选择》一书中，其明确了人类由古猿进化而来，而且极有可能起源于非洲大陆。
在当时，可想而知，如此惊世骇俗的观点，不仅受到了宗教势力的猛烈抨击，就连很多支持“进化论”的科学家也不认同。
于是，在一片反对声中，西方学者们，开始在欧洲、亚洲的土层中，寻找人类起源的证据，化石。令他们振奋不已的是，一件件古人类化石，从欧亚大陆相继浮出地面。
1856年，几名矿工，在德国的尼安德特峡谷中，挖出了一些人类骸骨化石，头盖骨与现代人类很相似，但又有明显差别，眉骨突出，前额扁平，小臂和小腿比现代人短，肘关节和膝关节异常粗大。他被命名为“尼安德特人”，生活在距今大约10万年-5万年前，于是， 西方学者认为，人类起源于欧洲。 并且，最多只有十万年的 历史 。
与此同时，一些西方学者，也正在亚洲进行 探索 。
半个多世纪后，时任北京协和医院，解剖系主任的加拿大人步达生，组织团队在北京周口店龙骨山挖掘，发现了一棵古人类牙齿化石，后经过测算，这棵牙齿的主人，生活在距今大约50万年前，后被命名为“北京中国猿人”也简称为“北京猿人”或“北京人”。
随后不久，即在1929年12月2日，北京大学地质学系裴文中的团队，继续在周口店的洞中挖掘，又找到一个完整的头盖骨，“北京猿人”头盖骨的发现，震惊了世界， 考古界认为，“北京猿人”不仅使人类起源地，从欧洲转移到了亚洲，即人类起源于亚洲， 还把人类起源 历史 ，向前延伸到了50万年前。
然而，就在相隔近半个世纪后，人类的起源地又发生了转移。
在东非大裂谷的最北端，埃塞俄比亚阿法三角区的一个考古营地里，即在1974年11月24日那天，美国古人类学家唐纳德·约翰逊组成的团队，挖出了一个头骨碎片，还有下颌骨、躯干骨等化石，可以拼成一具大致完整的人类骨架，“她”是一位女性，身高只有92厘米，解剖学特征表明，她能够经常直立行走。生存的年代，是距今大约330万年-280万年前，后来，她被命名为“露西”。
“露西”的发现，使非洲这片古老而神秘的大陆，热闹起来，越来越多抛弃偏见的科学家，来到这里， 探索 人类起源的秘密，
随后，在非洲不断被发现的，古人类化石，将人类的 历史 一次次地延长，也一次次证实了，达尔文的天才预言， 人类的远祖的确起源于非洲， 但是，随之而来的疑问也越来越多，究竟是古猿中的哪一支，进化成了人类。又为什么把进化的舞台，选在了非洲呢？
到了1984年时，英国人类学家克理斯·斯特林格，从1971年开始，采集当时世界各地最完整的古人类化石数据，并输入计算机建立模型，通过电脑来进行数据分析判断，数据得出的结论是： 今天世界上所有的人类，都出自非洲智人的后代。
并提出了“第二次走出非洲假说”的观点， 或说是 “替代假说” 论； 他说200万年前非洲直立人 第一次走出非洲 ，一部分直立人走出非洲，开始了漫长的远征，最终遍布欧亚大陆，其中进入欧洲的，后来成为 尼安德特人 ，到达亚洲的一支，后来进化成 北京猿人 ，和其他早期的人类。
大约10万年前 第二次非洲智人又走出非洲 ，替代了其他地区所有的人类，因其他地区的直立人种都早已灭绝。所以非洲“智人”与欧亚当地人种没有基因交流。这就是当时的非洲智人 “替代假说” 论。
到1987年，美国加州大学艾伦·威尔逊等遗传学家，通过对全世界不同种族的女性进行DNA分析，提出一个全新观点，今天地球所有人类，来源于一个共同的女性始祖，约二十万年前生活在非洲，她的后代约在13万年前走出非洲，扩散到世界各地。取代了非洲以外所有的古人类。这便是非洲 “夏娃假说” 论，进一步肯定了人类的 “非洲起源假说” 论。
从1998年开始，一些遗传学家通过父系DNA分析，更进一步证明，非洲“夏娃假说”论成立，支持“人类出自非洲说”的观点，说明非洲智人约在10万年前走出非洲，来到了东南亚地区，后又约在6万年前,向亚洲长江领域进发，直至东北亚地区。成为了中国人的祖先。
但，真的是这样吗？不！有许多科学家提出质疑。
如中国科学院院士吴新智等许多科学家就提出质疑。并提出了 “多地区起源进化假说 ”论观点。
如人类起源应由亚洲、欧洲、大洋洲、非洲等多地同时起源的假说。此 “多地区起源假说”论，是吴新智院士在1984年就提出来了。
到1998年，吴新智院士研究多年后，又提出了 “网状的连续进化附带杂交” 的新观点，进一步明确多地区人类起源，并与其他大陆人种进行杂交的学说。此“网状的连续进化附带杂交”学说，俗称“多点水波扩散交叉”理论。即人类就像水面上的多点起源，随机泛起波浪，必向四周扩散，那么，多点泛起的波浪必然会交叉相遇，所以说， 人类起源必然是多点起源，然后因迁移而发生相遇杂交， 这就是后来的人类基因为什么存在着，相互杂交融合的生物形态。因此“多点起源假说”很很PK了“非洲起源假说”。
随着古DNA分析技术的进一步发展，使得科学家直接从化石中提取DNA成为可能，又得益于高通量测序技术的出现，使得科学家能够获得准确的古DNA信息。
2010年，德国马普学会下属的进化人类学研究所，在分析了尼安德特人的DNA基因后，发现现代人与尼安德特人 拥有1%至4％ 的共同基因；从而，说明了多点起源杂交的可能性。
到了2014年，美国科学家又在《科学》杂志上发表文章，称尼安德特人的 基因有20% 留在了现代人的基因中，这意味着，现代智人与古老欧洲的人类有过基因交流。
于是，非洲起源学派，修改了 “夏娃假说” 为 “同化假说” ，也就是说，间接地承认了，吴新智院士的” “多地起源并杂交假说” 观点。
其观点认为，人类在迁移过程中，本土人类一直居于主体地位，外来人群起到一定程度的改造作用，但没有发生人类整体的替代。
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人类多地起源假说（上）