四川农业大学都江堰校区的前身是具有48年办学历史的国家级重点中专———四川林业学校。在深化高等教育体制改革的形势下，经四川省人民政府批准整体并入四川农业大学。其四川自然资源保护与发展培训中心、四川乔治亚国际语言中心、微软ATC培训与认证中心、应用3S技术中心在我省教育界声誉卓著。有关专家称，四川农业大学都江堰校区的成立，对促进四川省农林高等教育发展，培养大批高素质的生态环境保护和建设人才将起到积极作用。2009年11月17日下午，都江堰校区教职工大会在第三阶梯教室举行。学校校长郑有良教授、副厅级调研员何临春教授出席本次大会。校区领导及教职工200余人参加了大会。大会由都江堰校区党委书记刘川主持。会上，何临春首先代表学校宣读了关于都江堰分校更名为都江堰校区以及撤销职业技术师范学院、文理学院和新组建旅游学院、商学院的决定；并同时宣布了都江堰校区和旅游学院、商学院、城乡建设学院领导班子任免的决定。同时他就校区学院调整方案的实施作了具体的要求：一是旅游学院、商学院、城乡建设学院的学科专业方向分别为生态旅游与资源方向、商务与信息管理方向、建筑与城市规划方向；二是根据新的学科专业方向，将现有专业确定归属学院作为调整原则，与新的学科专业方向一致的专业确定为学院骨干专业并重点发展，教师按学院学科专业进行调整；实验室跟随专业划入相应学院，并组建与新的学科专业方向一致的实验室；三是明确了各项工作的时间安排，要求确保正常的教学和生活秩序。2014年学校党委决定，撤销城乡建设学院，新组建建筑与城乡规划学院、土木工程学院。撤销中共四川农业大学城乡建设学院总支部委员会，新组建中共四川农业大学建筑与城乡规划学院总支部委员会、中共四川农业大学土木工程学院总支部委员会，建筑与城乡规划学院、土木工程学院下设党总支办公室和行政办公室，至此都江堰校区形成一区四院的新格局。
