得这种病的芸豆沾染在根部或根部，病部出现病斑，出现棕色或黑色斑点，大部分开始从分叉的枝干扩散到主根，最终整个根部腐烂，坏死。生病的植物很容易拔，但随着茎的不断扩散，可能会表明地上的茎和叶萎缩或坏死。预防芸豆根腐败的最有效方法是轮作。其中，最好与白菜、葱、大蒜类一起循环。另外，药剂拌种剂为40%拌饭，可以选择种子重量的0.2% ~ 0.3%，2%菌克本克拌饭种，药种比1336060-RS或2.5%落后者(成本较高的种子)拌饭种多2%。
培育抗病品种。根据品种的不同，抗病性差异较大，在当地选择发病较轻的品种种植。掌握好种植密度，使田间通风良好。病发病初期发病时，每公顷可使用15%三唑仑(粉绿宁)加湿成分2000倍，生锈800倍。但也要进行合理的轮作，与非减员作物实行3年以上的轮作。挑选抗病能力强的种子，播种前要对种子进行精心消毒，种子购买要从正规的地方挑选，有缺陷的种子都要清除掉，不能使用。
要使用的芸豆种子，72%硫酸链霉素水溶性粉末500倍液浸泡24小时，或50%复味双湿粉，配合种子量的0.3%消毒后播种。药剂防治：松脂山铜200毫升蓝粉多菌灵400克发病前喷雾预防；发病后喷洒1号200毫升160万单位农用链霉素120-150克预防。7 ~ 10日一次，连续喷洒2 ~ 3次。
芸豆烂根死亡的原因大部分是因为碰上了病害。其中枯萎病是比较常见的疾病。这种病在开花时发病，但起初症状不明显。只是叶子有点黄，随着病的加重，变黄的部分也从下到上变得更加明显，叶脉也变成棕色，芸豆的叶子逐渐脱落。发育中后期开始发病的话，茎会变成棕色，严重的话，整个根会变成棕色，很容易拔出。茎腐病也是导致芸豆腐烂根死亡的原因。顾名思义，其病害部位主要发生在基础部，刚发病时疼痛部位有凹陷斑点，随着病情加重，病菌也深入到茎内组织，变成红砖色。发生这种疾病时，治疗也比较麻烦，所以要使用物理和化学相结合的治疗方法。