蒙古族的历史中，狼和鹿图腾崇拜占据重要地位。《蒙古秘史》记载了成吉思汗祖先与狼、鹿的关联，这种崇拜在北方草原根深蒂固。狼被视为神兽，与蒙古帝王的命运紧密相连，而鹿因其柔美而受到敬畏。"苍狼白鹿"图腾象征团结，体现了原始图腾崇拜的核心。
蒙古社会的图腾崇拜并非统一，如布里亚特人和达尔哈特人崇拜熊，熊在他们文化中具有重要地位，甚至被视作祖先。熊祭仪反映了图腾亲属观念和古老神话，早期有禁忌，但随时间发展，猎食熊的习俗也逐渐出现。布里亚特人的熊祭仪中，分食熊头肉可能源于原始图腾的圣餐仪式，熊崇拜与宗教活动密切相关，如吉利亚克人的过熊节。
布里亚特人还有芒牛图腾崇拜，其中的神话故事述说芒牛与母系社会观念有关，如女巫首领依都干与芒牛生子的传说。天鹅图腾则象征着天与母系崇拜，反映了早期思维中的妊娠神话。在父系社会旺盛期，天鹅图腾性别转换和化身为人，体现了主体意识的增强。鹰图腾是萨满神物的象征，反映了早期男性的权威。
树木图腾在北方蒙古族中较少见，但绰罗斯部的图腾神话表明他们对树木有古老崇拜。猎手在森林中发现的婴儿与大树的神话在阿尔泰语系民族中广为流传，反映了共同的地域环境和文化影响。蒙古族图腾神话的独特性与北方各民族，特别是阿尔泰语系神话的共通性，需要通过研究他们的环境、经济、社会和宗教背景来深入理解。
图腾崇拜，是发生在氏族公社时期的一种宗教信仰的现象。一般表现为对某种动物的崇拜，其也是祖先崇拜的一部分，图腾主要出现在旗帜，族徽，柱子，衣饰，身体等地方。而目前对于图腾崇拜的研究也是对于原始社会研究的重要组成部分，故图腾崇拜现象蕴含着重要的历史人文意义。