2006年9月29日，一场盛大的揭牌仪式在北京水利部水土保持生态工程技术研究中心举行。主持仪式的是水利部国际合作与科技司的高波司长，出席的嘉宾阵容强大，包括水利部副部长胡四一、水利部总工刘宁、中国工程院陈志恺院士、韩其为院士，以及工程中心管委会的领导等13人在主席台上就座。刘雅鸣司长，水利部人事劳动教育司的负责人，宣读了关于中心成立的正式批复文件。
在揭牌仪式上，水利部胡四一副部长、刘宁总工，工程中心管委会主任刘震司长，水利部水资源司高而坤司长，中国水利水电科学研究院匡尚富院长以及中科院资源环境与技术局冯仁国副局长发表了热情洋溢的致词。工程中心主任、中国水利水电科学研究院胡春宏副院长详细介绍了工程中心的基本情况。胡四一副部长和刘宁总工等共同揭开了工程中心的神秘面纱，标志着中心正式成立。
众多单位代表参与了这次盛会，包括水利部办公厅、水利部水利水电规划设计总院等直属单位，中国科学院直属单位，七大流域的水土保持部门，以及相关高等院校和科研机构的代表，新闻媒体也对此次揭牌仪式进行了报道。中国水利水电科学研究院的多位领导也出席了揭牌仪式。在揭牌仪式前，工程中心管委会在刘震主任的主持下召开了第一次工作会议，会议审议并通过了工程中心的章程和工作计划，还确定了专家委员会的名单，为工程中心的未来发展奠定了坚实的基础。