连云港站车站中心里程为CK1+483.49=（陇海线 K34+923.38），站坪长度3.2km。位于连云港市海州区，是陇海铁路的起点，为连云港地区主要客运站。
2015年改造前陇海铁路连云港站场规模为2台7线（陇海普速场），车站设有到发线7条（含正线），有效长850m，存车线2条，牵出线1条， 共有2条专用线在本站接轨，大型综合货场一处，配有货物线4条，建有工务段修配所一处，配有段管线3条，基本站台和中间站台各一座，人行天桥和旅客地道各一座。 主要办理客货列车的到发及通过作业，货场及油专线的取送调车作业，磷专（含电专） 的车辆交接作业。该站担当地区旅客列车的通过作业。2013年日均接发客车12对，2013年发送旅客156万人。
2015年开始改造的连盐铁路连云港站场的初期规模为4台12线（陇海、连盐普速场），车站设12米宽进站天桥1座、8米宽出站地道1座、6米宽行包地道1座，550.0×12×1.25m基本站台1座和中间站台3座，12条线路。其中，4条为正线（含陇海正线2条、连盐正线2条），有效长724～1396m。7条为旅客列车到发线、1条为火车到发线。
2016年建设的徐连客运专线配套新建客专站场规模为3台8线（徐连高速场），车站设置客车到发线4条、正线2条，有效长650m。新建450.0×12×1.25m旅客站台3座。新建连云港站动车存车场，位于连云港站西侧、蔷薇河东侧，设 9 条动车存车线。
连镇铁路将与徐连客运专线同期建设，设置规模为1台2线（连镇高速场），站场新增450.0×12×1.25m旅客站台1座，到发线2条（有效长650m），并在徐州端增设下行反向发车线。
到2020年，连云港站场的总规模将达到8台22线。 启用于1998年的连云港站，从正面看去是一个火车头的造型，因为建设年代较早，显得比较“土”。2017年启用的新站从现代交通建筑的功能性和经济性出发，以轻盈流畅的线条体现滨海港口城市的新面貌，屋顶飘逸飞扬的姿态象征连云港经济腾飞的动力，屋身两侧渐变的线条既隐喻波浪，又契合羽翼的形态，中间的拱形线条优美流畅，使人产生“海上生明月”的美妙联系，站房主体为地上二层，局部地下二层，总建筑面积近15000平方米，主体高19.5米，总长150米，总宽48米，整体一气呵成，大气简约。
在站房设计上采取屋顶出挑、设置百叶等措施，有效减少了西晒；候车大厅室内通透明亮，营造了舒适的候车环境；进站大厅地面使用防滑材料，设有残疾人专用卫生间，站台等服务设施地面均设置盲道，车站的各主要部位均设有残疾人电梯，实现全方位的无障碍进出站。
客站房的设计标准是地上两层，地下两层。地上承担候车功能和部分的商业功能，地下和地方配套承担社会车辆和出租车辆停车场功能。
连云港站南站房设置基本站台1座和中间站台3座，共有12条线路，其中4条为正线，7条为旅客列车到发线、1条为货车到发线，另外还有12米宽进站天桥1座、8米宽出站地道1座、6米宽行包地道1座。 南站房站前广场将分为地面和地下两个部分，地面部分为步行区域，地下为综合换乘区，分设出租车及社会车停车场，公交车则在站前道路设落客点，靠近出站口，方便进出站旅客使用。连云港站站区交通将体现“方便、畅通、快捷和互不干扰”的原则，合理组织各类车流，使其与城市道路快速连接，所有停车场尽量靠近站房布置，缩短乘客换乘距离。
南广场总体规划东、中、西三个地块：东地块以交通、酒店、办公、服务为主，具体功能有长途客运站、公交场站、酒店办公、配套商业服务等，其中长途车场与公交车场上下立体布置；西地块以商业、旅游、办公公寓为主，具体功能有零售餐饮、休闲娱乐、城市航站楼、旅游集散中心、办公SOHO等；中地块即站前广场部分，地下布置出租、社会车辆停车场、综合换乘大厅等设施。 主要功能为：公交、长途、出租（地下）、社会车辆（地下）、酒店及配套商业等。
