蒙古帝国的国脉起源于1206年，由孛儿只斤·铁木真（成吉思汗）统一蒙古高原诸部，建立了最初的蒙古帝国，持续至1635年。这个时期经历了大蒙古国（1206-1264年）、中国元朝（1271-1368年）和北元政权（1368-1480年）三个阶段。
大蒙古国时期，成吉思汗的继承者们依次为拖雷监国、窝阔台汗、乃马真后、贵由汗、海迷失后、蒙哥汗，以及阿里不哥。1271年，忽必烈建立元朝，成为中国历史上的元朝，直至元朝被明朝取代。
北元政权是元朝败退漠北后，元朝皇帝同时也是大蒙古帝国大汗的时期。元昭宗至顺天皇帝等多位统治者更迭，反映了蒙古帝国在衰败中的分裂与更替。这一阶段，蒙古贵族逐渐回归草原生活，汉化程度下降。
后蒙古帝国时期，达延汗（巴图孟克）至林丹（库图克图汗）的统治，标志着蒙古贵族对草原传统的重新适应。直至1641年，林丹汗之后，蒙古帝国国脉由其子额尔孔果洛额哲摄政，直到阿布奈和布尔尼等亲王的统治结束。
蒙古帝国（1206～1635），是历史上一个横跨欧亚大陆的大帝国，是大蒙古国扩张的结果，东到太平洋，北抵北冰洋，西达黑海沿岸（鼎盛时达匈牙利），南至南海。占了世界土地面积的22%，超越了1/5，为20世纪时苏联的1.5倍，现今俄罗斯的1.9倍，统治着1亿人口。东方人认为该帝国面积约达3,400万平方公里，目前官方公认为3,300万平方公里，但一些地区有争议，如《中国历史地图集》的蒙古帝国北疆到达喀拉海，所以最大的帝国是大英帝国还是蒙古帝国还待定