成立于1967年6月20日的日本跨洋航空公司，最初名为南西航空，从1967年7月开始运营。在航空业界的历史中，该公司经历了名称的变迁，1993年7月，南西航空更名为日本越洋航空。截至2007年3月，日本越洋航空的员工总数达到754人，其所有权结构颇具特色，由日本航空持有51.1%的股份，那霸机场航站占17%，冲绳县政府贡献了12.9%，其余19.1%的股份由其他股东持有。
在运营方面，日本越洋航空曾使用Convair 240机型，但随着母公司日本航空输送YS-11和波音737加入其机队，越洋航空的机型逐渐更新。在设备出现故障时，越洋航空会向日本航空寻求飞机支援。目前，由于其主要运营的是波音737-400，越洋航空还为母公司同型号的飞机提供维修服务，显示了两家公司之间的紧密合作。
在股权方面，日本越洋航空持有琉球空中通勤69.8%的股份，这进一步巩固了其在地区航空市场的地位。总的来说，日本跨洋航空公司凭借其历史、多元化所有权以及与母公司日本航空的紧密联系，构成了一个独特的航空服务网络。