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r语言主成分分析函数代码
使用
R语言
对SSR数据做
主成分分析
(PCA)的一个简单小例子
答:
使用到的是
R语言
的 poppr 包中的 read.genalex()
函数
poppr 第一次使用需要先安装 读入数据 读入数据直接是 genclone object,使用函数 genclone2genind() 将其转换成genind object,接下来使用 ade4 包中的 dudi.pca() 函数做
主成分分析
主成分的结果存储在li中 还是认为的分个组,然后做散点...
如何利用
r语言代码
进行
主成分分析
答:
princomp(x, cor = FALSE, scores = TRUE, covmat = NULL, subset = rep_len(TRUE, nrow(as.matrix(x))), )当cor = TRUE是使用相关系数矩阵计算 当cor = FALSE是使用协方差矩阵计算 用相关系数矩阵计算就相当于先标准化,在进行
主成分分析
用。
先用
主成分分析
然后进行聚类
分析r
编程。主成分的,和聚类的我都分别已...
视频时间 2:14
用R语言
做PCA的具体步骤
答:
PCA1 = princomp(exp[,2:(dim(exp)[2]-1)] )summary(PCA1)pc = loadings(PCA1)Comp.1 = PCA1$loadings[,1]Comp.2 = PCA1$loadings[,2]plot(Comp.1,Comp.2 ,col = c('red','red','red','green','green','green','blue','blue','blue'))此数据分为三组,所以我画了不...
《
R语言
实战》自学笔记71-
主成分
和因子
分析
答:
根据判别标准,保留1个
主成分
即可。 fa.parallel
函数
学习 fa.parallel(data,n.obs=,fa=”pc”/”both”,n.iter=100,show.legend=T/F) data:原始数据数据框; n.obs:当data是相关系数矩阵时,给出原始数据(非原始变量)个数,data是原始数据矩阵时忽略此参数; fa:“pc”为仅计算主成分,“fa”为因子
分析
,...
r语言中
怎样查看
函数源代码
答:
在
r
中看
函数源代码
:在
R
中,代码可以分为如下几个级别: 首先,是你输入了函数对象名称,你可以直接看到代码的,如要获得函数对象fivenum的代码,就只需要在Console中键入函数对象名称fivenum就可以得到如下结果:function (x, na.rm = TRUE){ xna <- is.na(x) if (na.rm) x <- x[!xna] else if (any(xna...
R语言
进行
主成分分析
scores代表的是新指标的值吗
答:
cor = TRUE使用相关系数矩阵计算 cor = FALSE使用协差矩阵计算 用相关系数矩阵计算相于先标准化进行主析 用协差矩阵计算进行标准化princomp
R语言
默认需要用别包用别包参数设置原理应该相同!
R语言
基本数据
分析
答:
R语言
基本数据
分析
本文基于R语言进行基本数据统计分析,包括基本作图,线性拟合,逻辑回归,bootstrap采样和Anova方差分析的实现及应用。不多说,直接上
代码
,代码中有注释。1. 基本作图(盒图,qq图)basic plot boxplot(x)qqplot(x,y)2. 线性拟合 linear regression n = 10 x1 = rnorm(n)#...
R语言
hist
函数
中参数breaks的问题
答:
HIST
函数
是用来创建一个直方图的 Matplotlib 函数。需要传的参数包括直方图的区间数、颜色、normed。参考例子如下:> data<-mtcars$wt#mtcars是
R
的内置数据集,选择wt列画图。> summary(data)#data最小值为1.513,最大值为5.424。Min.1st Qu.Median Mean 3rd Qu.Max.1.513 2.581 3.325 3.217 ...
R语言
常用数学
函数
答:
R语言
常用数学
函数
sum()、max()、min()、mean()、median()prod(x) 对x中的元素都连乘 which.max(x) 返回x中最大元素的下标 which.min(x) 返回x中最小元素的下标 range(x) 值域 rev(x) 对x中的元素取逆序 sort(x) 将x中的元素将升序排列 pmin(x,y) 返回一个向量,它的第i个...
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